Biokemijski proizvodi odnose se na različite tvari dobivene biokemijskim reakcijama. Njihov opseg obuhvaća same mikroorganizme, sekundarne metabolite koje proizvode mikroorganizmi i enzime koje sintetiziraju mikrobni organizmi. Osim toga, biokemijski proizvodi uključuju korisne tvari nastale pretvorbom supstrata kataliziranim enzimima, kao i proizvode koji nastaju mikrobnom fermentacijom supstrata u praktične proizvode.
U smislu specifične primjene, biokemijski proizvodi su raznoliki; uobičajene kategorije uključuju biokemijske reagense i instrumente koji se koriste u medicinskoj dijagnostici, etanol za gorivo koji služi kao čisti izvor energije te organske kiseline i njihove derivate koji se koriste kao sirovine u prehrambenoj i kemijskoj industriji.
